Hola reus91,
En mi opinión, los manuales de CEDE son más completos pero a la vez más redundantes y densos para estudiar: casi todo es texto corrido, muchas explicaciones vienen repetidas en distintas partes de los manuales, y en algunos temas viene tanta información adicional que como no tengas buena capacidad de síntesis puedes acabar perdiendo mucho tiempo en cosas que no son tan importantes.
Los de APIR, en cambio, son más visuales y se centran en los aspectos clave, pero sí es cierto que algunas áreas se quedan un poco escuetas. No obstante, dada la dificultad del examen de las últimas convocatorias, diría que la información que contienen es suficiente... (aunque esto siempre puede cambiar).
¿Cuáles son mejores? Pues depende. Cada uno tiene sus cosas buenas y malas, supongo que depende del método de estudio de cada uno, el tiempo del que disponga, los conocimientos previos que tenga... Es una elección bastante personal
En cualquier caso, ambos son buenos y siguen un esquema de contenidos similar.
Espero haberte ayudado!!
Saludos!!